目前，小龙虾养殖发展迅速，养殖面积不断扩大，养殖人群日益增大，在养殖过程中，会出现很多想不到的问题，如不及时正确处理，将会造成小龙虾的病害或死亡，制约小龙虾的产业的发展。
1、低温肥水
养殖肥水是小龙虾养殖越冬过程中必须进行的，水体呈现翠绿和茶色为好，现阶段常用肥料有复合肥，生物肥，各有特点，一般冬春季节常用肥水方法为解毒之后，使用生物肥，不必刻意追求绿藻水、硅藻水，水体溶氧高，水草好，水体清亮不长青苔稳定即可。
2、 接菌种
待春季水温达到10℃以上之后微生物活动加强，此时应接入枯草芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌等有益菌成为优势菌种。可以起到净化水质，预防青苔，减少发病的作用。
3 、除青苔
若水体过浅或者水体清瘦较易长青苔，一般加深水位，用一些青苔药处理即可，清除青苔之后肥水即可。但要及早发现、及时处理，若水体青苔已经过多处理则比较难。
二、在小龙虾养殖期间，会发生一些病害，4月中旬开始，很多养殖户为了能多卖点虾，每天不间断连续起虾，因此不达规格的小虾容易在起虾、放虾过程中受伤，进而导致细菌感染引起发病死亡；
1、肝胆综合征。5月份，温度升高，小龙虾的吃食量也增大，养殖户为了让小龙虾能够尽快上市，便盲目增加投喂量，喂高蛋白饲料，导致虾的肝脏负荷重，容易诱发肝胆综合征，导致小龙虾发病时大量死亡。
2、溶氧缺乏。5月份有些虾池的伊乐藻长势过于浓密，甚至长出了水面，养殖户却没有及时分行和割草头，伊乐藻长出水面不及时割草头就易死亡、腐烂进而败坏水质过多的草也会和小龙虾争夺空间和溶氧，还有一些养殖户虾池没种草，温度高虾没有遮阳蜕壳的场所，易形成红虾，也不利于蜕壳，因此小龙虾的规格较小。
3、养殖过程中小龙虾蜕壳是最为关键的，只有虾蜕壳了才能生长，经常养殖户会看到小龙虾蜕壳不遂，或是蜕了壳后就死了，亦或是被大虾给吃了；很多小龙虾养殖新手放苗时不清楚要放多少，有些养殖户也为了追求高产，把密度放得比较大，早期温度低，虾苗规格小问题不大，但后期虾逐渐长大，温度升高，吃食量也增大，因此容易把水体搞浑，夹草严重，也易缺氧；
小龙虾养殖过程中出现的一些疾病及防治措施：
1白斑病
白斑病是一种病毒病，爆发情况和水体温度、水质情况及虾的体质有直接关系。一般爆发时间为5、6月份。可通过经常加注新水降低水温，用水质改良剂调节水质及通过内服微量元素增强体质或降低养殖密度来预防。目前没有较好的治疗方案。
2软壳病
病因：体内缺钙，另外，光照不足、pH值长期偏低，池底淤泥过厚、虾苗密度过大、长期投喂单一饵料也可导致本病。
症状：虾壳软薄、体色不红、活动力差、觅食不旺、生长缓慢、协调能力差。
预防：（1）冬季清淤；（2）用生石灰清塘，放苗后每20天用25毫克/升生石灰泼洒；（3）控制放养密度；（4）池内水草面积不超过池塘面积30%；（5）投饵多样化，适当增加含钙饵料。
3烂壳病
病因：由假单胞菌、气单胞菌、黏细菌、弧菌或黄杆菌感染所致。
症状：病虾壳上有明显溃烂斑点，斑点呈灰白色，严重溃烂时呈黑色，斑点下陷，出现空洞，最后导致内部感染，甚至死亡。
预防：（1）运输投苗时操作要细致，伤残不入池，苗种下塘前用3%食盐水消毒5分钟；（2）平时操作小心，尽量不伤苗；（3）保持池水清洁；（4）投饵充足；（5）每15～20天用25毫克/升生石灰化水全池泼洒。
4黑鳃病
病因：虾鳃受真菌感染所致。
症状：鳃部由肉色变为褐色或深褐色，直至变黑，鳃组织萎缩坏死。患病的幼虾活动无力，多数在池底缓慢爬行，停食。患病的成虾常浮出水面或依附水草露出水外，不进洞穴，行动缓慢，最后因呼吸困难而死。
预防：（1）更换池水，及时清除残饵和池内腐败物；（2）用25毫克/升生石灰，定期消毒水体；（3）经常投喂青绿饲料；（4）在成虾养殖中后期，在池内放些蟾蜍。
5纤毛虫病
病因：由纤毛虫寄生所致，主要寄生种类包括聚缩虫、钟形虫、单缩虫和累枝虫等。
症状：体表、附肢、鳃上附着污物，虾体表面覆盖一层白色絮状物，致使小龙虾活动力减弱，食欲减退。
预防：（1）保持池水清新；（2）清除池内污物；（3）冬季清淤。
6螯虾瘟疫病
病因：由真菌引起。
症状：病虾体表有黄色或褐色斑点，在附肢和腿炳基部可发现真菌的丝状体。病虾呆滞，活动减弱或活动不正常，严重时会造成病虾大量死亡。
预防：（1）保持水体清新，维持正常水色和透明度；（2）适当控制放养密度；（3）冬季清淤；（4）平时注意消毒。
7烂尾病
病因：小龙虾受伤、相互残食或被几丁质分解细菌感染。
症状：感染初期病虾尾部有小疮，边缘溃烂、坏死或残缺不全，随着病情恶化，溃烂由边缘向中间发展，严重感染时，病虾整个尾部溃烂掉落。
预防：（1）运输和投放虾苗虾种时，不要堆压和损伤虾体；（2）养殖期间饵料要投足、投匀。
8出血病
病因：由产气单胞菌引起。
症状：病虾体表布满了大小不一的出血斑点，特别是附肢和腹部较为明显，肛门红肿，不久死亡。
预防：（1）保持水体清新，维持正常水色和透明度；（2）冬季清淤；（3）平时注意消毒。
9水霉病
病因：由水霉菌感染所致。
症状：病虾体表附生一种灰白色、棉絮状菌丝，患病的虾一般很少活动，不觅食，不进入洞穴。
预防：（1）当水温上升至15℃以上时，每15天用25毫克/升生石灰化水全池泼洒；（2）割去过旺水草，增加日照；（3）杜绝伤残虾苗入池，长了水霉死鱼不能作饲料；（4）每立方米水体按2克五倍子煎汁，稀释后泼洒全池。
10蜕壳不遂
病因：生长的水体缺乏某种元素。
症状：病虾在其头胸部与腹部交界处出现裂痕，全身发黑。
预防：（1）每15～20天用25毫克/升生石灰化水全池泼洒；（2）每月用过磷酸钙1～2毫克/升化水全池泼洒。
治疗：（1）饲料中拌入1‰～2‰蜕壳素；（2）饲料中拌入骨粉、蛋壳粉等增加饲料中钙质。
11水肿病
病因：小龙虾腹部受伤后感染嗜水气单胞菌。
症状：病虾头胸内水肿，呈透明状。病虾匍匐池边草丛中，不吃不动，最后在池边浅水滩死亡。
防治：在生产操作中，尽量减少小龙虾受伤。
12冻伤病
病因：在水温低于4℃时，虾将会冻伤。
症状：龙虾冻伤时，头胸甲明显肿大，腹部肌肉出现白斑，随着病情加重，白斑也由小而大，最后扩展到整个躯体。病虾初呈休克状态，平卧或侧卧在潜水草丛里。严重时，出现麻痹、僵直等症状，不久死亡。
防治：（1）早冬期，当水温降到10℃以下，应加深水位；（2）在越冬期间，可在池中投有机肥或稻草，促使水底微生物发酵，提高水温；（3）在秋冬季，注意多投含脂肪性饵料，如豆饼、花生饼、菜籽饼等。
13痉挛病
病因：在高温季节，由于经常捕捞，成虾受惊吓造成。
症状：主要症状是成虾腹部弯曲，严重的个体头胸部以下至尾部明显僵硬，并侧卧在水底不动，捕上后长时间不能恢复正常，轻者虽能做短暂划动，可身体呈驼背形，伸展不开，还有的病虾腹部变白，但不透明。
防治：（1）在高温季节尽量避免捕捞；（2）生产中要经常换新水，提高水位，改善水质；（3）发病后，要及时加注新水，连续5天。
14畸形病
病因：池水中重金属盐类过多和某种营养元素缺乏造成。
症状：病虾身体弯曲，有的尾部弯曲，有的尾部萎缩，有的附肢上刚毛变弯，甚至残缺不全。幼体趋光性较差，活动无力，多数沉入水底，蜕壳十分困难。
防治：（1）加强饲养管理，多喂含钙、磷及营养丰富的饲料；（2）亲虾在抱卵孵化时，控制水温22～25℃为宜，同时要严格禁止重金属盐入池，如锌、铜、铬等，保持池水清洁无污染。
15泛池
病因：主要是池水缺氧。
症状：池虾在缺氧时，烦躁不安，到处乱窜，有时成群爬到岸边草丛中不动，还有的爬上岸，如离开池水时间长了导致死亡。
防治：（1）冬闲期间，要及时清除过多淤泥，冻晒池底；（2）使用已经发酵的有机肥，控制水质过浓；（3）控制虾种放养密度；（4）常加新水，保持池水清爽。
小龙虾的病害都与养殖池塘或稻田的底质、水质有关，因此，在养殖过程中，坚持每10天进行改底和解水，长期保持地质和水质清新，为小龙虾营造优良的生态环境，既能减少小龙虾病害的发生，又能促进小龙虾生长。
